Siendo la segunda ciudad en tener mayor población del Perú, Arequipa cuenta con buen número de vuelos, siendo nada complicada la movilización al respecto. Los vuelos que se dirigen a Arequipa aterrizan en el aeropuerto Internacional Alférez Alfredo Rodríguez Ballón, siendo el tercero en cuanto a tráfico aéreo a nivel nacional (detrás del de Lima y Cuzco), trabajando con Peruvian Airlines, LAN Perú, Star Perú y Sky Airline. Los vuelos desde Lima para Arequipa pueden llegar a presentar un costo de 70 a 80 dólares aproximadamente, dependiendo de fechas y aerolíneas.